ADN polimerase Pfu
A ADN polimerase Pfu, também chamada Pfu DNA polimerase ou Pfu polimerase é uma ADN polimerase da arquea hipertermófila Pyrococcus furiosus. A sua função no microorganismo desta nucleotidiltransferase é a de replicar o seu ADN durante a divisão celular.
| ADN polimerase Pfu | |||||||
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![]() ADN polimerase Pfu Pyrococcus furiosus (PDB 2JGU)[1] | |||||||
| Indicadores | |||||||
| Número EC | 2.7.7.7 | ||||||
| Número CAS | 9012902-- | ||||||
| Bases de dados | |||||||
| IntEnz | IntEnz | ||||||
| BRENDA | BRENDA | ||||||
| ExPASy | NiceZyme | ||||||
| KEGG | KEGG | ||||||
| MetaCyc | via metabólica | ||||||
| PRIAM | PRIAM | ||||||
| Estruturas PDB | RCSB PDB PDBe PDBj PDBsum | ||||||
| Gene Ontology | AmiGO / EGO | ||||||
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A Pfu polimerase utiliza-se no laboratório para amplificar o ADN na reação em cadeia da polimerase (PCR), função para a qual apresenta várias vantagens em relação à enzima tradicionalmente usando Taq polimerase da bactéria termófilas Thermus aquaticus, uma vez que é termicamente mais estável e, acima de tudo, tem uma atividade exonuclease 3'-5' que permite eliminar os erros de inserção das bases durante a replicação (atividade de correcção de provas). Consequentemente, a PCR realizada com a Pfu polimerase é mais confiável do que a realizada com a Taq polimerase.
A Pfu polimerase disponível comercialmente gera uma taxa de erro de 1 por 1,3 milhões de pares de bases e pode produzir 2,6% de produtos mutados na PCR. Porém, é mais lenta que a Taq polimerase, uma vez que leva entre 1 a 2 minutos por ciclo para amplificar 1 kb de ADN a 72°C.
Historia
Os cientistas da empresa Stratagene, da Califórnia, descobriram as vantagens da Pfu em comparação com a Taq em 1991.[2] Obtiveram a patente 5.489.523 nos EUA sobre uma Pfu deficiente em actividade exonuclease e outra patente com o número 5.545.552 sobre a própria Pfu em 1996.
Referências
- Suhng Wook Kim, Dong-Uk Kim, Jin Kwang Kim, Lin-Woo Kang et Hyun-Soo Cho, « Crystal structure of Pfu, the high fidelity DNA polymerase from Pyrococcus furiosus », International Journal of Biological Macromolecules, vol. 42, no 4, 1er mai 2008, p. 356-361 DOI:10.1016/j.ijbiomac.2008.01.010. PMID 18355915
- Lundberg et al., "A High Fidelity Thermostable DNA Polymerase Isolated from Pyrococcus Furiosus," Strategies 4:34-35 (1991) e Gene 1991 Dec 12;108(1):1-6)
