TACK
TACK é um clado de organismos pertencntes ao domínio Archaea, cujo nome é um acrónimo para Thaumarchaeota (agora Nitrososphaerota), Aigarchaeota, Crenarchaeota (agora Thermoproteota) e Korarchaeota, os primeiros grupos de arqueias descobertos pertencntes ao clado. Estes microrganismos ocorrem em ambientes que variam de acidofílicos termófilos a mesófilos e psicrófilos e com diferentes tipos de metabolismo, embora predominantemente organismos anaeróbicos e quimiossintéticos.[3] TACK é um clado que é o grupo irmão do ramo Asgard que deu origem aos eucariontes. Foi proposto que o clado TACK seja classificado como Crenarchaeota e que o tradicional "Crenarchaeota" (Thermoproteota) seja classificado como uma classe chamada "Sulfolobia", em conjunto com os outros filos com nível taxonómico de classe.[4]
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![]() Sulfolobus sp. | |||||||
| Classificação científica | |||||||
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| Sinónimos | |||||||
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Classificação
- Thermoproteota (anteriormente Crenarchaeota) — grupo mais conhecida de Archaea e o mais abundante nos ecossistemas marinhos. Foram anteriormente considerados de sulfobactérias por causa de sua dependência em relação ao enxofre e são importantes como fixadores de carbono. Existem espécies hipertermófilas em fontes hidrotermais, mas alguns grupos são os organismos mais abundantes em profundidades inferiores a 100 m.
- "Aigarchaeota" — filo proposto a partir do genoma da espécie candidata Caldiaarchaeum, subterrânea, encontrada nas profundezas de uma mina de ouro no Japão. Sequências genómicas deste grupo também foram encontradas em ambientes geotérmicos, terrestres e marinhos.
- "Geoarchaeota" — organismos termofílicos que vivem em ambientes ácidos reduzindo o ferro férrico. Alternativamente, foi proposto que este e o grupo anterior realmente pertencem ao filo Nitrososphaerota.
- Nitrososphaerota (anteriormente Thaumarchaeota) — inclui organismos mesófilos ou psicrófilos (médias e baixas temperaturas), de metabolismo quimiolitoautotrófico oxidante de amónia (nitrificantes) que podem desempenhar um papel importante em ciclos bioquímicos, como os ciclos do azoto e do carbono.
- "Bathyarchaeota" — abundante nos sedimentos do fundo do mar com escassez de nutrientes. Pelo menos algumas linhagens apresentam homoacetogénese, um tipo de metabolismo até então considerado exclusivo das bactérias.
- "Korarchaeota" — encontrados em ambientes hidrotermais e em baixa abundância, parecem diversificados em diferentes níveis filogenéticos de acordo com a temperatura, salinidade (água doce ou marinha) e geografia.
Filogenia
Os dados disponíveis permitrm construir os seguintes cladogramas:
| McKay et al. 2019[5] | com base em 16S rRNA LTP_06_2022[6][7][8] | 53 marcadores proteicos de GTDB 08-RS214[9][10][11] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Hipótese eócita
A hipótese do eócito proposta na década de 1980 por James Lake sugere que os eucariotas emergiram dentro dos eócitos procarióticos.[12] Neste contexto, uma evidência que suporta uma estreita relação entre TACK e eucariotas é a presença de um homólogo da RNA polimerase subunidade Rbp-8 em Thermoproteota, mas não em Euryarchaea.[13]
Ver também
Referências
- Lake, J.A.; Henderson, E.; Oakes, M. (Clark, M.W.) (1984). «Eocytes: A new ribosome structure indicates a kingdom with a close relationship to eukaryotes». PNAS. 81 (12): 3786–3790. PMC 345305
. PMID 6587394. doi:10.1073/pnas.81.12.3786
- Lake, J.A. (2015). «Eukaryotic origins». Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci. 370 (1678). 20140321 páginas. PMC 4571561
. PMID 26323753. doi:10.1098/rstb.2014.0321 - Guy, Lionel; Ettema, Thijs J.G. (2011). «The archaeal 'TACK' superphylum and the origin of eukaryotes». Trends in Microbiology. 19 (12): 580–587. doi:10.1016/j.tim.2011.09.002
- Cavalier-Smith, Thomas; Chao, Ema E-Yung (2020). «Multidomain ribosomal protein trees and the planctobacterial origin of neomura (Eukaryotes, archaebacteria)». Protoplasma. 257 (3): 621–753. PMC 7203096
. PMID 31900730. doi:10.1007/s00709-019-01442-7 - McKay, L.J., Dlakić, M., Fields, M.W. et al. Co-occurring genomic capacity for anaerobic methane and dissimilatory sulfur metabolisms discovered in the Korarchaeota. Nat Microbiol 4, 614–622 (2019) doi:10.1038/s41564-019-0362-4
- «The LTP». The All-Species Living Tree Project. Consultado em 10 Maio 2023
- «LTP_all tree in newick format». The All-Species Living Tree Project. Consultado em 10 Maio 2023
- «LTP_06_2022 Release Notes» (PDF). The All-Species Living Tree Project. Consultado em 10 Maio 2023
- «GTDB release 08-RS214». Genome Taxonomy Database. Consultado em 10 Maio 2023
- «ar53_r214.sp_label». Genome Taxonomy Database. Consultado em 10 Maio 2023
- «Taxon History». Genome Taxonomy Database. Consultado em 10 Maio 2023
- (UCLA) The origin of the nucleus and the tree of life Arquivado em 2003-02-07 na Archive.today
- Kwapisz, M.; Beckouët, F.; Thuriaux, P. (2008). «Early evolution of eukaryotic DNA-dependent RNA polymerases». Trends Genet. 24 (5): 211–5. PMID 18384908. doi:10.1016/j.tig.2008.02.002
- Cox, C. J.; Foster, P. G.; Hirt, R. P.; Harris, S. R.; Embley, T. M. (2008). «The archaebacterial origin of eukaryotes». Proc Natl Acad Sci USA. 105 (51): 20356–61. Bibcode:2008PNAS..10520356C. PMC 2629343
. PMID 19073919. doi:10.1073/pnas.0810647105

